Добрый день!
Цитата: Принципал поручил Агенту закупить товар, Агент на УСН, Принципал на ОСН.
Агент действует от своего имени, но за счет принципала.
"От своего имени" означает, что агент, заключая сделку купли-продажи (поставки) выступает, как покупатель. Поэтому Поставщик выписывает все документы, включая счет-фактуру, на своего покупателя, т.е. агента.
Но, поскольку агент действует за счет Принципала, то он перевыставляет все документы поставщика (а, главное, счет-фактуру) принципалу в том же виде, в каком получил от поставщика. Если поставщик выставил счет-фактуру с НДС, то и агент должен перевыставить его принципалу с НДС. И всё описать в Отчете агента, где и добавить своё агентское вознаграждение, без НДС.
При этом агент обязан отразить входящий и исходящий счета-фактуры в журналах учета входящих и исходящих счетов-фактур.
Если агент, который на УСН, не является налоговым агентом по НДС по другим поводам (т.е., не сдаёт налоговую декларацию по НДС), то он должен сдать в ИФНС эти журналы входящих и исходящих счетов-фактур в электронном виде до 20 числа месяца, следующего после завершившегося квартала.
При этом агент не должен платить никакого НДС.
А принципал имеет возможность поставить НДС поставщика у себя к вычету.
А журналы, которые должен представить агент в ИФНС обеспечивают принципалу проверку его Книги покупок.
Успехов!